У рамках Комісії створено 4 Робочі групи:
Кількість проведених засідань: 11 засідань.
Останнє засідання: 23 – 24.10.2019, м. Нюрнберг.
Наступне засідання: 12-те засідання Комісії має відбутися у м. Києві.
Основні напрями співробітництва, які опрацьовувалися під час останнього засідання: торгівля, інвестиції, співробітництво між міністерствами внутрішніх справ та антикорупційними органами, співробітництво у галузі сільського та лісового господарства, енергоефективність, наукове співробітництво, гуманітарна сфера.
У рамках останнього засідання Комісії підписано:
Ключові домовленості останнього засідання:
17 листопада 2020 року Міністр розвитку громад та територій України Олексій Чернишов провів робочу зустріч з Керівником реферату міжнародних відносин Баварської державної канцелярії, Співголовою Постійної українсько-баварської робочої комісії Крістофом Штьоклє та керівником бюро Вільної держави Баварія Вікторією Калініченко.
Під час зустрічі сторони обговорили питання щодо здійснення обміну досвідом у боротьбі з COVID-19. Домовились розглянути пропозиції баварських компаній щодо співпраці з Україною та здійснити інтенсифікацію українсько-баварського співробітництва між Баварією та українськими територіями та громадами, а також в рамках імплементації зеленого курсу ЄС. Сторони домовились провести наступне засідання Комісії наприкінці 2021 року.